体积小巧是5500相对以前仪器非常重要的改进。5500集所有附件为一体。面板有切换阀，下面有一个预留的位置，可以供客户再装一个阀。离子源在中间，右边是针泵(向上走),右上边是仪器状态显示灯。体积比前几代型号减少了44%。

API5500系统在硬件上的六大技术创新：

接口的改进：提高了QaQ/MRM 灵敏度。

创新的QJet-2 离子透镜，极大地提高了系统的灵敏度，改善了真空的分配。

创新的弯曲的LINAC 碰撞室，提高了离子传输速度，增加了离子容量，改善了质谱数据质量。

提供了线性加速的离子阱Linear Accelerated Trap: 更快的扫描速度，更快的分析时间。

优点：

更高离子容量的线性离子阱

灵敏度提高(阱的扫描灵敏度提高了100倍)

扫描速度提高5倍(20,000 amu/sec)

离子填充时间缩短20倍

分辨率提高2倍(优于12,000)

质荷比精度提高3倍

创新的AcQuRate 脉冲离子计数检测器：确保系统的重现性和精确性。

创新的eQElectroics 电子系统：确保快速扫描，ES 的快速正负切换。